華南農(nóng)業(yè)大學: 茶樹葉片發(fā)育過程中DNA甲基化對兒茶素和萜烯類生物合成的動態(tài)修飾
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華南農(nóng)業(yè)大學: 茶樹葉片發(fā)育過程中DNA甲基化對兒茶素和萜烯類生物合成的動態(tài)修飾

近日,Horticultural Plant Journal在線發(fā)表了華南農(nóng)業(yè)大學劉少群團隊題為“Dynamic DNA methylation modification in catechins and terpenoids biosynthesis during tea plant (Camellia sinensis) leaf development(茶樹葉片發(fā)育過程中DNA甲基化對兒茶素和萜烯類生物合成的動態(tài)修飾)”的研究論文。

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研究背景
茶樹(Camellia sinensis)是一種重要的經(jīng)濟作物,其葉片富含次生代謝物。兒茶素和萜烯類物質(zhì)對于茶葉滋味和香氣具有重要貢獻,其含量及種類隨茶樹葉片的發(fā)育發(fā)生了顯著變化。DNA甲基化在植物生長發(fā)育及次生代謝中扮演著重要的角色。然而,關于DNA甲基化對茶樹葉片發(fā)育過程中次生代謝物的調(diào)控仍不清晰。

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研究問題

本研究以‘嶺頭單叢’茶樹嫩葉和老葉為材料,通過全基因組DNA甲基化測序、轉(zhuǎn)錄組測序以及色譜分析技術,從DNA甲基化、基因轉(zhuǎn)錄和物質(zhì)代謝三個層面,共同探討在茶樹葉片發(fā)育過程中,DNA甲基化的變化規(guī)律及其對于兒茶素、萜烯類代謝的潛在調(diào)控作用,研究結(jié)果可為提高茶葉原料利用率、輔助茶樹育種提供理論指導。

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研究結(jié)果

(1)在茶樹葉片發(fā)育過程中,全基因組DNA甲基化水平顯著升高,并在全基因組背景下有著相似的DNA甲基化水平分布。


圖1茶樹葉片發(fā)育過程中DNA甲基化水平變化及在染色體上的分布情況

(2)全基因組DNA甲基化水平的顯著升高主要受到甲基轉(zhuǎn)移酶CMT2、CMT3、MET1和去甲基化酶DME共同調(diào)控。

圖2茶樹葉片發(fā)育過程中DNA甲基化相關基因的表達變化

(3)差異表達基因中只有少部分與差異甲基化區(qū)域相關聯(lián)。功能富集分析表明與差異甲基化區(qū)域相關聯(lián)的差異表達基因顯著富集于苯丙烷、類黃酮及萜烯類通路上。


圖3DNA甲基化與轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析

(4)兒茶素合成關鍵基因SCPL1A、LAR等以及萜烯類物質(zhì)合成關鍵基因NES的基因表達水平顯著受到DNA甲基化的調(diào)控。說明在茶樹葉片發(fā)育過程中,DNA甲基化的動態(tài)變化對于兒茶素及萜烯類物質(zhì)的組成及含量具有重要影響。

圖5兒茶素及萜烯類代謝通路中關鍵基因的差異甲基化區(qū)域可視化

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意義和創(chuàng)新性

解析了茶樹葉片發(fā)育過程中DNA甲基化圖譜變化,DNA甲基化對兒茶素和萜烯類代謝的潛在調(diào)控作用,為表觀遺傳調(diào)控茶樹次生代謝提供一定的見解。

作者及團隊介紹

碩士研究生陳家浩為該論文的第一作者,孫彬妹副教授和劉少群研究員為該文的通信作者。本科生胡楊、朱張生副教授、鄭鵬高級農(nóng)藝師參與了本研究。

來源:Horticultural Plant Journal HPJ編輯部,

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